濁水溪與曾文溪之間的分隔，源於地理與生態的多樣性。兩者各自擁有獨特的水文特徵與生態系統，若強行合併，將破壞原有的生態平衡，影響水質與生物多樣性。因此，保護兩者的獨立性，對於維護環境健康至關重要。